Deimantė Žilinskienė turi daugiau nei 8 metų patirtį vadovaujant projektams aukštojo mokslo stebėsenos ir tyrimų, bakalauro ir magistro lygio studijų programų rengimo ir valdymo, aviacijos vadybos, žmogiškųjų išteklių valdymo, verslumo ir švietimo valdymo srityse nacionalinėse institucijose ir privačiose organizacijose (Mokslo ir aukštojo mokslo stebėsenos ir analizės centre, Mykolo Romerio universitete, Lietuvių kalbos institute, Kazimiero Simonavičiaus universitete).
Ji dėsto su socialinių mokslų metodologija susijusius dalykus, taip pat dalyvauja tokiuose moksliniuose projektuose kaip EUCA Invest (Investavimas į verslumo universitetus Kaukaze ir Vidurinėje Azijoje), SI-DRIVE (Socialinės inovacijos: socialinių pokyčių varomoji jėga), žaidimų, aviacijos vadybos ir IRT projektai, aktyviai dalyvauja „Erasmus+“ dėstymo mobilumo programoje.
Deimantė Žilinskienė yra Lietuvos standartizacijos tarybos (ISO) ekspertė ir nacionalinė ekspertė Pasaulinėje ISO /TC 260/WG 11 mokymosi ir tobulėjimo grupėje, susijusioje su ISO standartais mokymosi ir tobulėjimo srityse. Nuo 2022 m. studijuoja vadybos krypties doktorantūroje. Nuo 2023 m. ji buvo išrinkta Lietuvos nacionalinės aviacijos asociacijos (LAVIA) generaline sekretore ir vykdančia direktore. Deimantė yra 3 mokslinių knygų bendraautorė ir yra paskelbusi iki 12 mokslinių tarptautinių straipsnių vadybos, aviacijos pramonės ir aukštojo mokslo srityse.